元龜3年（1572年）時甲斐的武田信玄發動西上作戰，於三方原之戰中擊敗了三河的德川家康後，在上洛後遭到信長變相架空權力的幕府將軍足利義昭趁勢在天正元年（1573年）2月正式宣告加入信長包圍網，15日時開始招募丹波國的牢人為士兵[2]，在2月19日向越前朝倉義景求援，而朝倉義景也發兵六、七千人南下[3][2]。
獲知足利義昭與自己為敵後，信長派出島田秀滿、村井貞勝與朝山日乘擔任使者前往與足利義昭和談，甚至表示要送人質給足利義昭[4][1]，但義昭也在當月27日表示拒絕[5][2]。
與此同時，足利義昭為防備信長的攻擊，命令山岡景友和磯貝新右衛門、渡邊黨聯合一向一揆於近江國的今堅田和石山兩處構築城砦起兵對抗織田家[4][1]。並且對松永久秀、三好義繼表示赦免，要求兩人率軍進入山城國宇治[5]。
但信長在與足利義昭進行和談時，早於2月20日便派遣柴田勝家、丹羽長秀和蜂屋賴隆、明智光秀四將率軍出擊，24日時渡過瀨田攻擊山岡景友率領的甲賀眾跟伊賀眾鎮守的石山砦，當時城砦尚未完全建好，受到織田家包圍後，山岡景友在2月26日便戰敗投降，並毀去石山砦[4]。
堅田城隨後在同月29日遭受織田軍明智光秀、丹羽長秀跟蜂屋賴隆的攻擊[1]，明智光秀率水軍穿越琵琶湖從城池的西面攻擊，丹羽長秀和蜂屋賴隆則經由陸路從城池的南面攻擊，最後明智光秀在當日午時佔領此城[4]，斬首三百多人[1][6]，守將渡邊宮內少輔跟磯貝新右衛門戰敗後逃亡[7]，明智光秀在戰後因功入駐坂本城，而柴田勝家、丹羽長秀和蜂屋賴隆則率軍返回岐阜城[4]。
信長隨後在3月25日親自率領進入京都，足利義昭的家臣細川藤孝和原先偏向反信長陣營的荒木村重在29日時聯合在逢坂迎接，等於對外表示臣服織田家，信長親自佈陣在知恩院，旗下大軍分別在白川、粟田口、祇園、清水、六波羅、鳥羽、竹田等地宿營，信長也贈荒木村重一口鄉義弘的刀，贈送細川藤孝名物脇差。足利義昭也在30日包圍了織田家臣村井貞勝的宅邸，並派兵警衛朝臣、禁裏[8]。
在4月3日進入京都的信長再度遣使向足利義昭求和，甚至還請出正親町天皇下令，並且在京都外圍地區放火[4]，進而直接率軍包圍了二條城，在信長的恩威並用下，足利義昭被迫同意使和談成立[1]，信長派遣兄長織田信廣為名代，跟足利義昭正式交涉，待和談成立後信長便在4月7日撤軍返回了美濃岐阜城，且在撤軍途中讓柴田勝家、丹羽長秀、佐久間信盛、蜂屋賴隆及蒲生賢秀包圍鯰江城的六角義治[4]。
朝倉義景雖早在3月11日從敦賀出陣南下，獲知足利義昭又和信長講和後，在4月中旬派遣山崎吉家跟魚住景固率3千人轉往進攻若狹，收割粟屋勝久的國吉城附近的糧食[9]。
但足利義昭實際上並未放棄繼續抵抗信長的想法，在4月20日時向吉田兼和調集人夫進行二條城的增築，企圖加強城池的防備[10]，並且在6月時向安藝的毛利輝元請求支兵糧[11]。而信長也在5月時讓丹羽長秀、岡部又右衛門在5月時收集來自多賀、山田的木材於琵琶湖畔著手建造，全長三十間、幅七間、櫓百挺備足的大船，足可容納三千、五千人[12][1][4]。